日御碕地区は、島根半島の最西端に位置し、東に鵜鷺地区、杵築地区と南北に境を接し、西に日本海に向けて突き出た地形であり、古くから「御碕」とも呼ばれ、「日御碕」の地名の起源となっている。

日御碕地区は、北山が東西に走り、半島西端の海に没している起伏の多い山地で平地がほとんどなく、海岸線が入り組み、景観に優れ、大山隠岐国立公園の区域に入っている。